從花上區別：石榴為雌雄花同株不同花植物，雄花呈三角狀，而雌花下部膨大明顯呈小葫蘆形。花石榴的花多為復瓣，而且雌花少而雄花多。而果石榴的花單瓣者多，也有個別品種為復瓣者（如泰山大花石榴），雌雄花數基本相等。

從果上區別：花石榴以觀花為主，也有觀果者，只是果實小而食用性差，花呈圓筒形，多不結實。而果石榴果實大而汁多，口感好。石榴樹上的花是典型的雜生花，既有雄花（鐘狀花）和兩性花（葫蘆狀和中間類型）。雄花不能結果，兩性花容易結果，是結果主力。花石榴和果石榴都具備這樣的花型！按照花期看，花石榴的的開花期明顯比果石榴長得多！花石榴一般在5~11月開花，一般邊開花邊結果。果實成熟的時候還有一些花存在。果石榴的花期在5~7月。